Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top1Q04750 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top1Q04750 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms