Protein–RNA interactions for Protein: Q03401

Crisp1, Cysteine-rich secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp1Q03401 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Crisp1Q03401 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Crisp1Q03401 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms