Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms