Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gjb4Q02738 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gjb4Q02738 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms