Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snai1Q02085 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snai1Q02085 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snai1Q02085 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms