Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp1Q01514 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp1Q01514 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms