Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1cQ00896 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1cQ00896 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1cQ00896 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1cQ00896 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Serpina1cQ00896 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Serpina1cQ00896 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Serpina1cQ00896 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Serpina1cQ00896 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms