Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Itga4Q00651 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga4Q00651 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms