Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GabpaQ00422 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GabpaQ00422 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GabpaQ00422 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabpaQ00422 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabpaQ00422 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabpaQ00422 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabpaQ00422 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabpaQ00422 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GabpaQ00422 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GabpaQ00422 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GabpaQ00422 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GabpaQ00422 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GabpaQ00422 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabpaQ00422 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabpaQ00422 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GabpaQ00422 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabpaQ00422 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GabpaQ00422 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabpaQ00422 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GabpaQ00422 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GabpaQ00422 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms