Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tcf7Q00417 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tcf7Q00417 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms