Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pax8Q00288 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pax8Q00288 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms