Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PgrQ00175 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PgrQ00175 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PgrQ00175 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms