Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VegfdP97946 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfdP97946 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfdP97946 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VegfdP97946 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VegfdP97946 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VegfdP97946 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms