Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfra1P97785 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra1P97785 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms