Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nbr1P97432 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nbr1P97432 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nbr1P97432 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms