Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkp1P97350 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pkp1P97350 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms