Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vgll3P85442 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll3P85442 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms