Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
H3f3aP84244 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
H3f3aP84244 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms