Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElocP83940 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElocP83940 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElocP83940 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElocP83940 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElocP83940 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElocP83940 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElocP83940 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElocP83940 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElocP83940 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElocP83940 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ElocP83940 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ElocP83940 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ElocP83940 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ElocP83940 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ElocP83940 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ElocP83940 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ElocP83940 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ElocP83940 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ElocP83940 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ElocP83940 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ElocP83940 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ElocP83940 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ElocP83940 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ElocP83940 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ElocP83940 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ElocP83940 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElocP83940 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElocP83940 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElocP83940 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElocP83940 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElocP83940 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElocP83940 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElocP83940 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElocP83940 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElocP83940 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ElocP83940 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ElocP83940 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ElocP83940 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ElocP83940 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ElocP83940 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ElocP83940 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms