Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cbx1P83917 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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