Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx1P81068 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx1P81068 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx1P81068 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx1P81068 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx1P81068 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx1P81068 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx1P81068 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx1P81068 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx1P81068 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx1P81068 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms