Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx2P81066 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx2P81066 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx2P81066 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx2P81066 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx2P81066 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx2P81066 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx2P81066 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx2P81066 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms