Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otx2P80206 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Otx2P80206 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms