Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dlx4P70436 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms