Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rad50P70388 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad50P70388 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad50P70388 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad50P70388 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms