Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sema3eP70275 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema3eP70275 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms