Protein–RNA interactions for Protein: P70227

Itpr3, Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itpr3P70227 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itpr3P70227 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itpr3P70227 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms