Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf6P70196 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf6P70196 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf6P70196 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf6P70196 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf6P70196 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf6P70196 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms