Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf5P70191 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf5P70191 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf5P70191 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf5P70191 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf5P70191 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf5P70191 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf5P70191 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf5P70191 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf5P70191 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms