Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps27aP62983 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms