Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ElobP62869 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ElobP62869 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ElobP62869 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ElobP62869 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ElobP62869 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ElobP62869 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ElobP62869 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ElobP62869 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ElobP62869 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ElobP62869 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ElobP62869 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms