Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra1P62812 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms