Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Snrpd1P62315 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpd1P62315 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms