Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps18P62270 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps18P62270 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps18P62270 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps18P62270 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rps18P62270 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rps18P62270 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms