Protein–RNA interactions for Protein: P62082

Rps7, 40S ribosomal protein S7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps7P62082 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rps7P62082 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rps7P62082 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms