Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ufm1P61961 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms