Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Taf13P61216 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf13P61216 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf13P61216 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf13P61216 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Taf13P61216 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Taf13P61216 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms