Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Actr1aP61164 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Actr1aP61164 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms