Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2d1P61080 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2d1P61080 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.4 ms