Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chp1P61022 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chp1P61022 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chp1P61022 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chp1P61022 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chp1P61022 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chp1P61022 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chp1P61022 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms