Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snap25P60879 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snap25P60879 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap25P60879 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap25P60879 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap25P60879 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Snap25P60879 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snap25P60879 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Snap25P60879 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap25P60879 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap25P60879 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap25P60879 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap25P60879 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap25P60879 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap25P60879 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap25P60879 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap25P60879 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snap25P60879 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms