Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup43P59235 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup43P59235 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms