Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scarf2P59222 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms