Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Senp1P59110 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Senp1P59110 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Senp1P59110 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp1P59110 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Senp1P59110 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms