Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdl3P58873 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms