Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tpm2P58774 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm2P58774 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms