Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strn4P58404 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Strn4P58404 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Strn4P58404 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strn4P58404 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strn4P58404 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strn4P58404 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strn4P58404 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strn4P58404 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Strn4P58404 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms