Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms