Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pcbp4P57724 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pcbp4P57724 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms