Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lad1P57016 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lad1P57016 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lad1P57016 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lad1P57016 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lad1P57016 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lad1P57016 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms